产业学院实行理事会领导下的院长负责制。产业学院成立由校企医三方（或学校、企业、医院、行业协会等多方）代表组成的理事会，负责对产业学院办学中有关专业设置和专业建设、培养方案制订、课程建设、“双师双能型”教师队伍建设、行业企业专兼职教师选派、校内外实验实习实训基地建设等重大问题进行审议、决策、检查、指导、咨询、监督和协调。理事会设立理事长1人、副理事长1人，理事若干人。可以聘任高校、企业、医院、行业协会的知名人士担任名誉理事。每1届理事会任期3年。理事会每学期至少召开1次会议。

        产业学院设院长1名，由院领导兼任；副院长若干名，其中至少1名副院长由企业、医院、行业协会方人员担任。产业学院下设综合办公室（校企医合作办公室），并配备专职管理人员负责产业学院的校企合作工作。

        大连东软信息学院提供办学经费、办学场地、基础设施、部分教学仪器设备、实训室；企业、医院、行业协会提供部分师资、教学仪器设备、实践基地和实习岗位；校企医合作进行智慧影像设备研发、生产、维护、应用、图像处理与分析、辅助临床诊疗等。